Welcome to MCCCS-X’s documentation!

Contents:

• 1. Installation and Running
  • 1.1. Docker
  • 1.2. Singularity
  • 1.3. Windows 10
  • 1.4. Ubuntu
  • 1.5. Minnesota Supercomputing Institute
    • 1.5.1. Mesabi
  • 1.6. Siepmann Group
    • 1.6.1. Metropolis
• 2. Input files
  • 2.1. fort.4
    • 2.1.1. mc_shared
    • 2.1.2. analysis
    • 2.1.3. mc_volume
    • 2.1.4. mc_swatch
    • 2.1.5. mc_swap
    • 2.1.6. mc_cbmc
    • 2.1.7. mc_simple
    • 2.1.8. SIMULATION_BOX
    • 2.1.9. MOLECULE_TYPE
    • 2.1.10. MC_SWAP
    • 2.1.11. MC_SWATCH
    • 2.1.12. INTERMOLECULAR_EXCLUSION
    • 2.1.13. UNIFORM_BIASING_POTENTIALS
  • 2.2. topmon.inp
  • 2.3. fort.77
• 3. Algorithms
  • 3.1. Coupled-Decoupled Configurational-Bias Monte Carlo
  • 3.2. CBMC
  • 3.3. SAFE-CBMC
  • 3.4. AVBMC
• 4. References

Indices and tables

• Index

• Module Index

• Search Page